Βιβλιοθήκες γραμμένες σε Nextflow
rnaseq
Σωλήνας ανάλυσης αλληλουχίας RNA χρησιμοποιώντας STAR, RSEM, HISAT2 ή Salmon με μετρήσεις γονιδίων/ισομορφών και εκτεταμένο ποιοτικό έλεγχο.
- 646
- MIT
sarek
Διοχέτευση ανάλυσης για την ανίχνευση βλαστικών ή σωματικών παραλλαγών (προεπεξεργασία, κλήση παραλλαγής και σχολιασμός) από WGS / στοχευμένη αλληλουχία.
- 256
- MIT
configs
Αρχεία διαμόρφωσης που χρησιμοποιούνται για τον καθορισμό παραμέτρων ειδικά για υπολογιστικά περιβάλλοντα σε διαφορετικά ιδρύματα (κατά nf-core).
- 71
- MIT